在我國規模化養殖業快速發展，蛋白源飼料資源短缺、動物疾病疫情嚴重和禁抗事業全面實行的大背景下，中草藥以其豐富的生物活性物質和抗菌、抗氧化、抗炎、免疫強化等功效，成為最有潛力的抗生素替代物。本團隊針對構樹、金銀花、杜仲、平臥菊三七、韭菜、枳殼等中草藥以及其副產物開展了包括內生菌分離、鑒定、活性篩選、發酵以及利用現代組學方法分析了發酵中草藥體內外功能的系列工作。本項目利用植物內生菌結合新型酵母培養副產物的使用，研發出具有功能性、低含水量、發酵簡單、性價比高的內生菌發酵中草藥產品。系列產品的開發將為我國中草藥及副產品的高值利用和畜牧業飼用抗生素的替代提供有效的途徑。
